Knorr folgt als Flugbetriebsleiter auf Flugkapitän Jürgen Raps, der zum 1.September Bereichsvorstand Operations der Lufthansa Passage Airlines wird und als Accountable Manager gegenüber dem Bundesministerium für Verkehr, Bau und Stadtentwicklung sowie der Europäischen Agentur für Flugsicherheit (European Aviation Safety Agency) verantwortlich ist. Der Flugbetrieb besteht aus den Flotten Boeing 747-400, Airbus A340/A330, A300-600 und in Kürze A380 sowie Kurzstrecke (Airbus-A320-Familie und Boeing 737), der Crewplanung und dem Operational Support mit dem stellvertretenden Leiter Flugbetrieb.

Werner Knorr wurde am 24. November 1956 in Lamspringe/Niedersachsen geboren und schloss 1983 sein Studium der Flugtechnik an der Universität Braunschweig ab. Noch in der Studienzeit trat er 1980 in die Lufthansa Verkehrsfliegerschule ein und wurde drei Jahre später Copilot auf Boeing 737. In der Folge flog er verschiedene Flugzeugtypen wie Boeing 747-400 und Airbus A340. 1995 wurde er Flugkapitän auf der Airbus-A320-Familie. Im Oktober 1995 übernahm Werner Knorr die Position des Technischen Piloten, im Jahr darauf die Leitung der Hauptabteilung Flugbetriebsstandards. 2000 wechselte er zu Lufthansa Cargo und leitete dort den Flugbetrieb, später die Global Freight Operations. In dieser Zeit war er auch als Langstreckenpilot auf dem Frachtflugzeug Boeing MD-11F tätig. 2004 wechselte er auf Airbus A340. Als Leiter der Geschäftseinheit Regional koordinierte und steuerte er ebenfalls von 2004 an die fünf im Namen von Lufthansa operierenden Regionalfluggesellschaften.

Am 1. Oktober 2005 trat Werner Knorr schließlich in die Condor-Geschäftsführung ein und verantwortete das Ressort Operations.